memphologi bakteri berdasarkan bentuk selnya bakteri di bedakan:

Bakteri dengan bentuk basil (batang)
Pada pengelompokan bakteri dengan bentuk tubuh menyerupai batang atau biasa di sebut basil ini berdasarkan pengelompokannya dibagi lagi menjadi tiga yaitu:
1. Monobasil
atau bakteri yang memiliki bentuk tubuh menyerupai batang tunggal. Contohnya seperti bakteri pada usus yaitu Escherichiacoli bakteri.
2. Diplobasil
yaitu bentuk bakteri menyerupai batang yag berkoloni dua. Contohnya yaitu Salmonella typhosa yang merupakan bakteri penyebab penyakit tipus.
3. Streptobasil
yaitu bakteri yang berbentuk batang dengan koloni lebih dari dua sehingga terlihat bentuknya menyerupai rantai. Contohnya bisa kita lihat pada bakteri pengikat nitrogen yaitu Azotobacter atau contoh lainnya pada bakteri penyebab antraks yaitu Bacillus antracis.
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk diplobasil contohnya yaitu Salmonella typhosa
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk monobasil contohnya yaitu Escherichiacoli bakteri
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk streptobasil contohnya yaitu Bacillus antracis
Bakteri dengan bentuk bulat (coccus/kokus)
Selanjutnya yaitu pengelompokan bakteri dengan bentuk bulat atau biasanya disebut coccus (kokus). Berdasarkan bentuk dan jumlah koloninya, bakteri kokus ini dibedakan lagi menjadi beberapa kelompok, yaitu:
1. Kelompok bakteri Monococcus
yaitu bakteri yang berbentuk bulat tunggal. Contohnya yaitu pada bakteri Neisseria gonorrhoeae.
2. Kelompok bakteri Diplococcus
yaitu bakteri berbentuk bulat (kokus) dengan jumlah koloni dua. Contohnya seperti pada bakteri Diplococcus pneumoniae.
3. Kelompok bakteri Streptococcus
yaitu kelompok bakteri berbentuk kokus (bulat) yang saling bergandengan sehingga membentuk koloni menyerupai rantai. Contohnya yaitu: Streptococcus lactis, Streptococcus salivarius.
4. Kelompok bakteri Sarcina
merupakan kelompok bakteri kokus/bulat dengan bentuk koloni menyerupai kubus, contohnya seperti pada bakteri Sarcina sp.
5. Kelompok bakteri Stafilokokus
yaitu kelompok bakteri kokus bentuk bulat yang memiliki koloni bergerombol menyerupai buah anggur, contohnya yaitu pada bakteri Staphylococcus aureus.
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Monococcus contohnya yaitu Neisseria gonorrhoeae
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Diplococcus contohnya yaitu Diplococcus pneumoniae
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Streptococcus contohnya yaitu Streptococcus salivarius
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Sarcina contohnya yaitu Sarcina sp
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Stafilokokus contohnya yaitu Staphylococcus aureus
Bakteri dengan bentuk spiral
Berbeda dengan bentuk basil dan kokus yang dikelompokan lagi berdasarkan jumlah koloni yang dibentuk, pada bentuk spiral ini dibagi lagi berdasarkan bentuk spiral sempurna dan tidak beserta alat geraknya. Pembagian kelompok spiral ini adalah:
1. Kelompok bakteri Spiral
yaitu pengelompokan bakteri bakteri yang berdasarkan bentuk tubuh yang menyerupai spiral, misalnya Spirillum.
2. Kelompok bakteri Vibrio
yaitu pengelompokan bakteri yang menyerupai bentuk koma, dimana bentuk koma ini dianggap menyerupai bentuk spiral yang tidak sempurna, contohnya seperti penyebab penyakit kolera Vibrio cholerae.
3. Kelompok bakteri Spiroseta
yaitu kelompok bakteri yang berbentuk spiral dan bisa bergerak. Seperti misalnya pada bakteri penyebab penyakit sifilis yaitu Spirochaeta palida.
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Spiral contohnya yaitu Spirillum
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Vibrio contohnya yaitu Vibrio cholerae
Pengelompokan bakteri berdasarkan bentuk Spiroseta contohnya yaitu Spirochaeta palida